[Markus]

Wenn nun während der Therapie die Antikörper ansteigen wäre das ein Beweis für die (bisher nur vermutliche, weil seronegativ) Borreliose und die Borreliose könnte weiter (richtig) behandelt werden.

Wenn dein Arzt bei Yersinien nicht von den Leitlinien abweicht, wieso sollte er es dann bei der Borreliose tun?

Wegen deinem Test: Ich würde eher nochmal in einem anderen Labor (z.B. Labor Volkmann) einen zweiten Western Blot machen. Man kann mit einem Testkit negativ, mit dem anderen positiv getestet werden.